El informe final 2016 de Contraloría sobre la asignación de la gratuidad dectectó una serie de falencias en el control de los requisitos que deben cumplir los estudiantes para recibir el beneficio. Desperfecto que impediría al Mineduc regular que jóvenes ya titulados vuelvan a acceder al beneficio, y que estudiantes continúen recibiéndolo pese a haber superado los plazos estipulados por las universidades para egresar de las carreras.
Así mismo, en el informe realizado asegura que entregó la Subsecretaría dwe Educación a la contraloría, como informó diario El Mercurio, "es incompleta o errónea debido a que no tiene todos los antecedentes sobre los títulos otorgados con anterioridad al 2007".
Frente a a estos acontecimientos el ente fiscalizador afirmó que se le asignó el beneficio de la gratuidad al menos 86 personas ya contaban con un título profesional, cifra que se traduce en una merma de $204 millones.